Этиология
Вирусология
Коронавирус-2, вызывающий тяжелый острый респираторный синдром (SARS-CoV-2) – это ранее неизвестный бета-коронавирус, который был обнаружен в образцах бронхоальвеолярного лаважа, забор которого был выполнен у групп пациентов с пневмонией неизвестной этиологии в городе Ухань (провинция Хубэй, Китай) в декабре 2019 года.[28]
Коронавирусы представляют собой большое семейство вирусов, некоторые из них вызывают заболевания у людей (например, простуду, тяжелый острый респираторный синдром [SARS], ближневосточный респираторный синдром [MERS]) и другие, которые циркулируют среди млекопитающих и птиц. Редко коронавирусы животных могут заражать людей, а затем распространяться между людьми, как это было в случае с MERS и SARS.
SARS-CoV-2 относится к подроду Sarbecovirus семейства Coronaviridae и является седьмым известным коронавирусом, которым может инфицироваться человек. Было обнаружено, что вирус похож на SARS-подобные коронавирусы летучих мышей, однако он отличается от SARS-CoV и MERS-CoV.[29][30]
Информация о вариантах SARS-CoV-2 представлена ниже в разделе Классификация.
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: На иллюстрации изображена ультраструктурная морфология коронавируса 2, вызывающего тяжелый острый респираторный синдром (SARS-CoV-2), установленная в ходе электронной микроскопииЦентры по контролю и предупреждению заболеваний [Citation ends].
Происхождение вируса
Большинство пациентов, изначально пострадавших во время вспышки, сообщали о связи с Южно-Китайским рынком морепродуктов Хуанань, что указывает на зоонозное происхождение вируса.[31][32][33] Первоначальная оценка динамики заражения первых 425 подтвержденных случаев показала, что 55% случаев до 1 января 2020 года были связаны с рынком, тогда как после этого дня с рынком были связаны только 8,6% случаев. Это указывает на то, что с середины декабря 2019 года произошло заражение тесно контактировавших с больными.[33] Согласно последним исследованиям, вирус мог появиться ранее, чем предполагалось.[34]
Зоонозное происхождение по-прежнему не подтверждено. В некоторых исследованиях было выдвинуто предположение о том, что SARS-CoV-2 может быть рекомбинантным вирусом между коронавирусом летучей мыши и коронавирусом неизвестного происхождения, при этом возможными промежуточными хозяевами являются панголины и норки. Впрочем, в настоящее время доказательные данные, демонстрирующие возможный способ передачи от летучих мышей человеку через один или несколько промежуточных видов животных, отсутствуют.[35] Для определения происхождения SARS-CoV-2 необходимы дальнейшие исследования.
Динамика передачи инфекции
Преобладающим способом передачи выступает воздушно-капельная передача, при которой основными факторами риска являются близкое расстояние и вентиляция.[36] Имеющиеся данные свидетельствуют о том, что передача инфекции между людьми происходит в первую очередь тогда, когда инфицированный человек находится в тесном контакте с другим человеком. Вирус может распространяться изо рта или носа инфицированного человека в виде мелких жидких частиц (размером от крупных капель до мелких аэрозолей), когда человек кашляет, чихает, поет, тяжело дышит или разговаривает. Контакт на близком расстоянии может привести к вдыханию вируса или заражению вирусом через рот, нос или глаза.[37]
Воздушно-капельная передача возможна в медицинских учреждениях в ходе процедур, во время которых генерируется аэрозоль. Также, согласно некоторым сообщениям о вспышках, в определенных обстоятельствах аэрозольная передача возможна во внебольничных условиях; однако в этих сообщениях речь идет о скоплении людей в закрытых помещениях с плохой вентиляцией, где инфицированный человек может тяжело дышать (например, рестораны, репетиции хора, залы для фитнеса).[37][38] Подробные расследования этих кластеров свидетельствуют о том, что в этих случаях заражение также можно объяснить передачей воздушно-капельным путем или через фомиты.[37] Несмотря на то, что воздух вблизи и на расстоянии от пациентов часто содержал РНК SARS-CoV-2, жизнеспособный вирус в этих образцах выявляли редко.[39] Риск передачи на открытом воздухе намного ниже, чем в помещении, и по данным ограниченного количества исследований составляет <1%.[40] Доказательства того, что лечение небулайзером увеличивает риск передачи коронавирусов, аналогичных SARS-CoV-2, неубедительны, при этом прямых доказательств риска передачи SARS-CoV-2 немного.[41]
Возможна передача через фомиты (вследствие непосредственного контакта с фомитами), однако в настоящее время убедительных доказательств этого способа передачи получено не было. В некоторых случаях предполагаемой передачи через фомиты нельзя было полностью исключить воздушно-капельный путь передачи.[36] В большинстве исследований сообщают об идентификации вируса на поверхностях неодушевленных предметов, однако доказательств, подтверждающих восстановление жизнеспособности вируса, недостаточно.[42]
Фекально-оральная передача (или воздушно-капельная передача через фекалии в форме аэрозоля) возможна, однако данные в поддержку такого способа передачи ограничены.[36]
Передача через другие жидкости организма (включая передачу половым путем или через кровь) зарегистрирована не была.[36] Вирус был обнаружен в жидких средах организма (например, в сперме, моче, спинномозговой жидкости, глазных жидкостях), однако наличие вируса или вирусных компонентов не приравнивается к инфицирующей способности.[43] Данные о риске передачи инфекции от доноров органов ограничены. Впрочем, риск передачи инфекции через органы, отличные от легких (например, почки, печень, сердце), от SARS-CoV-2-положительных доноров невысок, независимо от того, были ли у донора симптомы на момент забора.[44]
Перинатальная (вертикальная) передача происходит редко, также были получены данные о передаче через плаценту. Данные о масштабах вертикальной передачи и ее сроках ограничены.[45] Фрагменты вируса были обнаружены в грудном молоке; однако это явление встречается редко и ассоциируется с легкими симптомами у младенцев.[46]
В одном систематическом обзоре нозокомиальную передачу отмечали у 44% пациентов; впрочем, этот обзор был ограничен серией случаев на раннем этапе вспышки в Ухане до принятия соответствующих мер профилактики и контроля инфекции.[47] В период с февраля по август 2020 года на внутрибольничные инфекции приходилось около 11,3% в Великобритании. Этот показатель достигал пика 15,8% в середине мая. В октябре 2020 года в некоторых регионах частота составила 25%. Показатели были значительно выше в больницах интернатного типа (61,9%) и психиатрических больницах (67,5%) по сравнению с больницами неотложной помощи и больницами общего профиля (9,7%).[48][49] Исследования контактов медицинских работников с индексными случаями (без проведения процедур, генерирующих аэрозоль) показали, что нозокомиальная передача практически не происходит при условии применения контактных и капельных мер безопасности.[50] Риск для медицинских работников, выполняющих трахеостомию или ассистирующих во время этой операции, является низким.[51]
BMJ: visualising SARS-CoV-2 transmission routes and mitigations Opens in new window
Динамика передачи и ее связь с симптомами
Передача более вероятна, если контакт происходил незадолго до или после появления симптомов у индексного пациента. В одном исследовании риск передачи инфекции тесным контактам был выше, если контакт происходил через 2–3 дня после появления симптомов у индексного пациента. Среди инфицированных контактов бессимптомная инфекция была более распространена в случаях, когда они контактировали с бессимптомным индексным пациентом, и это позволяет предположить, что тяжесть заболевания у индексного пациента может ассоциироваться с клинической картиной заболевания.[52]
Дальнейшая передача инфекции зависит от конкретных факторов, связанных с хозяином и контактом, а также от характера воздействия. Факторы, связанные с увеличением передачи:[53]
Факторы окружающей среды: закрытые помещения, плохая вентиляция, массовое скопление людей, близкое соседство, общие помещения, низкая температура окружающей среды, низкая влажность
Факторы, связанные с хозяином: недавняя инфекция, высокая вирусная нагрузка, тяжелое заболевание, возраст, наличие сопутствующих заболеваний, ослабленный иммунитет
Поведенческие факторы: пение/крики, кашель/чихание, объятия/поцелуи, этикет ношения масок, гигиена рук, длительность контакта
Вирусные факторы: изменения вирусного генома, связанные с повышенной трансмиссивностью.
Симптомная передача
Передача в основном происходит воздушно-капельным путем или через аэрозоли при тесном контакте с инфицированным человеком с симптомами заболевания. Трансмиссивность зависит от объема жизнеспособного вируса, выделяемого человеком, от типа контакта, условий, а также предпринимаемых мер профилактики и контроля.[37]
Досимптомная передача
Передача возможна во время инкубационного периода до возникновения симптомов.
Несмотря на доказательства передачи вируса от людей до развития у них симптомов заболевания, данные о том, как часто это может происходить, ограничены, а расчетные показатели передачи сильно варьируют.[54][55]
Согласно одному систематическому обзору, среди лиц, контактировавших с носителем заболевания, у которого еще не развились симптомы, заразилось только 7% людей.[56]
У людей без симптомов возможен досимптомный период или бессимптомное течение заболевания.
Бессимптомная передача инфекции
Отмечали случаи передачи заболевания от пациентов без симптомов (лабораторно подтвержденные случаи заболевания у пациентов, у которых симптомы полностью отсутствовали); впрочем, большинство данных основаны на информации, которая была получена из Китая на раннем этапе пандемии, имеющей ограничения (такие как небольшое количество случаев, вероятность досимптоматических случаев).[57][58][59][60][61][62][63] Во многочисленных исследованиях не была подтверждена бессимптомная передача от носителей SARS-CoV-2, в том числе в большом исследовании, в которое вошло около 10 млн жителей города Ухань.[64][65][66][67] Согласно одному систематическому обзору, среди лиц, контактировавших с бессимптомным носителем заболевания, заразились только 1% людей, что свидетельствует об ограниченной контагиозности.[56]
Оценить распространенность бессимптомных случаев среди населения сложно. По данным одного систематического обзора и метаанализа, межквартильный размах для доли бессимптомных случаев составлял 14–50% в разных исследованиях; однако гетерогенность была высокой, поэтому в исследовании не оценивали среднюю долю бессимптомных инфекций в целом.[68] Метаанализ более 130 000 человек показал, что 21,7% оставались бессимптомными на протяжении всего периода инфекции (после исключения предсимптомных случаев). Анализ подгруппы показал, что общая частота бессимптомных инфекций была выше у беременных женщин (48,8%) и детей (32,1%). В африканских исследованиях сообщается о самом высоком уровне бессимптомных инфекций, в то время как в азиатских исследованиях – о самом низком.[69]
Медицинские работники могут служить источником инфицирования с бессимптомной передачей. Приблизительно у 7,6% медицинских работников из стационарных отделений с пациентами с COVID-19 результат теста на антитела к SARS-CoV-2 был положительным; впрочем, только 58% этих работников сообщали о симптомах.[70]
Несмотря на небольшое количество доказательств того, что у детей старшего возраста более высока частота бессимптомного заболевания, чем у младенцев в возрасте <1 года, у большинства детей заболевание сопровождается симптомами и они не являются скрытыми разносчиками инфекции.[22]
Случаи суперраспространения
Были получены сообщения о случаях очень быстрого распространения заболевания. Эти случаи связаны с бурным ростом в начале вспышки и устойчивой передачей на более поздних стадиях. Среди примеров – церковные/религиозные собрания, семейные или общественные собрания, репетиции хоров, развлекательные спортивные мероприятия в помещении, ночные клубы, рестораны, бизнес-конференции и работа в колл-центрах. Также сообщалось о суперраспространении в учреждениях длительного ухода, в приютах для бездомных, в тюрьмах, на предприятиях по обработке мяса и птицы, а также на круизных лайнерах.[71]
Сообщалось об ограниченной передаче в детских учреждениях, школах и университетах.[72][73] Имеются ограниченные высококачественные доказательства для количественного оценивания степени передачи в школах или для ее сравнения с передачей среди местного населения. Однако доказательные данные свидетельствуют о более низком общем уровне заражения школьного персонала (1,18%) по сравнению с учащимися (1,66%). Новые данные свидетельствуют о низком уровне общей частоты инфекционных атак и показателях положительности на SARS-CoV-2 в школьных условиях.[74][75] В периоды низкой заболеваемости среди местного населения в школах, где принимают немедикаментозные меры, риск для школьного персонала, как правило, не выше, чем у населения в целом, и не сопоставим с другими профессиями высокого риска (например, работниками здравоохранения). Исследования, в которых сообщается о периодах высокой заболеваемости, ограничены, но показывают более высокий риск для школьного персонала в этих условиях.[76] В одном из исследований инфицирование близких контактов в средних школах и колледжах Англии отмечали редко (приблизительно 2%).[77]
У некоторых людей наблюдается супервыделение вируса, однако причины, лежащие в основе событий суперраспространения, часто являются многофакторными, нежели простое избыточное выделение вируса, и могут включать различные факторы, связанные с поведением, хозяином и окружающей средой.[78]
Факторы передачи вируса
Инкубационный период
Репродуктивное число (R₀)
Последовательный интервал
Частота вторичного поражения
Совокупная частота вторичного инфицирования среди всех близких контактов индексного случая составляет 7%, согласно данным, полученным на раннем этапе пандемии.[86] Совокупный показатель варьирует в зависимости от условий контакта: согласно оценкам, в домашних условиях он составляет 18,9–21,1% (по состоянию на 17 июня 2021 года), в медицинских учреждениях 3,6%, в социальной среде 1,2–5,9%, и на рабочих местах 1,9%. Этот показатель выше для случаев с симптоматическим индексным случаем по сравнению с бессимптомными случаями, а также у взрослых по сравнению с детьми.[68][87][88][89] В недавнем метаанализе сообщалось о более высокой общей частоте вторичного поражения 37,3%, обусловленного циркулирующими вариантами SARS-CoV-2, в домашних условиях.[90] Общий совокупный уровень вторичного поражения в учреждениях по уходу за престарелыми был значительно выше: 42% среди проживающих и 22% среди персонала.[91] Показатель у детей и молодежи был выше в домашних условиях по сравнению со школьными.[92] Частота вторичного поражения для различных вариантов SARS-CoV-2 может отличаться. Частота вторичного поражения для варианта Омикрон выше по сравнению с другими вариантами SARS-CoV-2.[90][93] Для получения дополнительной информации смотрите ниже раздел Классификация.
Вирусная нагрузка
Вирусная нагрузка является ведущим фактором передачи вируса; более высокие вирусные нагрузки ассоциируются с увеличением частоты вторичного поражения и более высоким риском развития симптоматического заболевания.[94] Вирусная нагрузка наиболее высока в верхних дыхательных путях (носоглотке и ротоглотке) на раннем этапе развития инфекции (обычно достигает пика на первой неделе заболевания), и затем увеличивается в нижних дыхательных путях (мокрота). После появления симптомов вирусная нагрузка снижается. У пациентов с тяжелым заболеванием вирусная нагрузка выше, чем у пациентов с легким заболеванием. Вирусная нагрузка в верхних дыхательных путях сопоставима у пациентов с симптомами и без симптомов; впрочем, в большинстве исследований продемонстрировано более быстрое выведение вируса у людей без симптомов, по сравнению с людьми с симптомами.[95]
Вирусовыделение
Средняя длительность выделения вируса зависит от вида: 17 дней в образцах из верхних дыхательных путей (максимум 83 дня); 14,6 дня в образцах из нижних дыхательных путей (максимум 59 дней); и 17,2 дня в образцах кала (максимум 126 дней). Длительность вирусовыделения была выше у пациентов с симптомами, по сравнению с пациентами без симптомов, а также у пациентов с тяжелым заболеванием по сравнению с пациентами с нетяжелым течением.[95] Пациенты с ослабленным иммунитетом могут быть распространителями на протяжении как минимум 2-х месяцев.[96] Известно о случаях супервыделителей, которые выделяют вирус в течение длительного времени (самым продолжительным был случай, когда результат теста оставался положительным в течение 505 дней).[97] Нет убедительных доказательств того, что длительность вирусного распространения коррелирует с длительностью инфицирования.[98] У пациентов с легким или умеренным течением заболевания через 10 дней после появления симптомов, а также у пациентов с тяжелым или критическим заболеванием через 20 дней после появления симптомов не был выделен жизнеспособный вирус, несмотря на продолжение вирусовыделения.[36] У полностью вакцинированных людей выделение вируса может быть менее длительным по сравнению с частично вакцинированными или не вакцинированными людьми.[99]
Провокационные испытания с участием людей
Первое провокационное испытание с участием человека было опубликовано на сервере для предварительных публикаций (без рецензирования). В целом 36 волонтерам 18–29 лет без доказательств перенесенной инфекции либо вакцинации инокулировали интраназальную дозу вируса SARS-CoV-2 дикого типа. Заразились 18 добровольцев (53%). У большинства (89%) симптомов либо не наблюдалось, либо они характеризовались легкой или умеренной степенью. У инфицированных лиц выделение вируса стало количественно измеримым в мазках горла спустя 40 часов. Вирусная нагрузка резко возрастала и достигала пика через 5 дней после инокуляции. Вирус сначала выявляли в горле, однако его уровни возрастали до значительно больших в носу в течение 10 дней после инокуляции.[100]
Патофизиология
Точная патофизиология остается неизвестной, отчасти из-за недостаточного количества патологоанатомических исследований.[101] Патофизиология напоминает патофизиологию других коронавирусных инфекций. Впрочем, новые данные указывают на то, что COVID-19 имеет отличительные патофизиологические особенности, которые отличают его от дыхательной недостаточности другого происхождения.[102]
SARS-CoV-2 прикрепляется к рецептору ангиотензинпревращающего фермента-2 (АПФ2) на клетках-мишенях организма-хозяина, после чего происодит интернализация и репликация вируса. Рецепторы АПФ2 экспрессируются в большом количестве в клетках верхних и нижних дыхательных путей, но также экспрессируются в клетках миокарда, клетках почечного эпителия, энтероцитах и эндотелиальных клетках различных органов, что может объяснять внелегочные проявления, связанные с заболеванием.[103] РНК вируса была выявлена во многих органах при патологоанатомических исследованиях.[101]
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: Мультиорганные осложнения COVID-19 и затяжной COVID. Вирус SARS-CoV-2 получает возможность проникновения в клетки различных органов через рецепторы АПФ2BMJ. 2021;374:n1648 [Citation ends].
Вирус использует мембраносвязанную сериновую протеазу 2 (TMPRSS2) хозяина для примирования спайкового белка вируса и слияния клеточных мембран вируса и хозяина.[104] Спайковый белок SARS-CoV-2 играет ключевую роль в распознавании рецептора АПФ2 и в процессе слияния клеточной мембраны. Уникальная структурная особенность рецептор-связывающего домена гликопротеина шиповидных отростков обеспечивает потенциально более высокую аффинность связывания для АПФ2 на поверхности клеток-хозяев по сравнению с SARS-CoV-1.[105] У других коронавирусов нет места расщепления фуриноподобным веществом.[106] Энергия связывания между спайковым белком и АПФ2 из всех видов, изученных в одном исследовании, была наибольшей у людей, а это указывает на то, что спайковый белок эволюционировал уникальным образом и теперь способен связываться с клетками человека, экспрессирующими АПФ2, и инфицировать их.[107] Новые данные свидетельствуют о том, что один спайковый белок может повреждать эндотелиальные клетки, подавляя AПФ2 и, следовательно, подавляя функцию митохондрий. Необходимы дальнейшие исследования способности спайкового белка самостоятельно запускать клеточную сигнализацию, которая может привести к различным биологическим процессам.[108][109] Варианты SARS-CoV-2 могут быть более трансмиссивными, по крайней мере частично, из-за повышенной связывающей способности спайкового белка по отношению к рецептору ACE2.[110]
[Figure caption and citation for the preceding image starts]: Цикл репликации вирусаBMJ. 2020; 371:m3862 [Citation ends].
Помимо непосредственного цитопатического вирусного поражения, тяжелое заболевание часто осложняется вызванной инфекцией микроангиопатией или состоянием гиперкоагуляции, которое вызывает капиллярный, венозный и/или артериальный тромбоз, что может привести к повреждению органа-мишени вследствие отдаленного тромботического или эмболического заболевания. При патологоанатомических исследованиях распространенные микротромбы были обнаружены почти в каждом органе. В большинстве случаев летального исхода патологическое исследование выявляло диффузное альвеолярное повреждение, коагулопатию и нарушение гемодинамики. Поражение других органов, помимо легких, ограничивалось легким паренхиматозным воспалением (например, миокардитом, гепатитом, энцефалитом). Непосредственное цитопатическое вирусное поражение других органов, помимо легких, в целом не рассматривали как причину органной недостаточности.[101][103] Большинство результатов в отношении органов, отличных от легких, были связаны с хроническими заболеваниями.[111] Эндотелиит, вызванный SARS-CoV-2, может влиять на респираторные и нереспираторные проявления.[112]
В посмертной легочной ткани появились три основных тканевых фенотипа: классический фенотип, характеризующийся прогрессирующим диффузным альвеолярным повреждением; бронхопневмония на фоне вторичной инфекции; и тромбоз тканей. Эти фенотипы не исключают друг друга и могут накладываться друг на друга.[113]
Плацентит, обусловленный SARS-CoV-2, является отдельной патологией у беременных женщин, которая характеризуется массивным перивиллезным отложением фибрина и хроническим гистиоцитарным интервиллозитом. Это состояние ассоциируется с повышенным риском выкидыша.[114]
Определенную роль в восприимчивости к инфекции и тяжести заболевания могут играть генетические факторы; впрочем, необходимы дальнейшие исследования.[115][116][117][118]
Классификация
Классификация вариантов коронавируса 2-го типа, вызывающего тяжелый острый респираторный синдром (SARS-CoV-2)
Все вирусы, в том числе SARS-CoV-2, со временем меняются. Большинство изменений практически не влияют на свойства вируса; впрочем, некоторые изменения могут повлиять на передачу вируса, тяжесть заболевания и эффективность диагностических тестов, лекарственных средств или вакцин.
Эти варианты появляются и циркулируют по всему миру от самого начала пандемии. Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) регулярно отслеживает и классифицирует их как варианты под наблюдением, варианты, представляющие интерес, или варианты, вызывающие обеспокоенность (включая вариант, вызывающий обеспокоенность – линии, в отношении которых проводят мониторинг).[2] Эти системы классификации могут отличаться в зависимости от страны. Например, в Великобритании варианты классифицируются Агентством по безопасности здравоохранения Великобритании (UKHSA) только как варианты, вызывающие обеспокоенность. Классификации вариантов под наблюдением и исследуемых вариантов использовались ранее, но с тех пор не применяются.[3] В США варианты классифицируются Центром по контролю и профилактике заболеваний (CDC) следующим образом: варианты под наблюдением, варианты, представляющие интерес, или варианты со значительными последствиями.[4]
ВОЗ ввела простые названия для основных вариантов, используя буквы греческого алфавита. Они не заменяют существующих научных названий (например, Pango, Nextstrain, GISAID), которые по-прежнему используются в исследованиях.[2]
Вариант, представляющий интерес
ВОЗ определяет вариант, представляющий интерес, как вариант с генетическими изменениями, которые предположительно или определенно влияют на характеристики вируса, такие как трансмиссивность, тяжесть заболевания, ускользание от иммунного ответа, диагностики или лечения; и который, согласно имеющимся данным, вызывает значительную передачу инфекции среди населения или появление множественных кластеров случаев во многих странах с увеличением относительной распространенности наряду с увеличением количества случаев со временем, или другие очевидные эпидемиологические воздействия, указывающие на новый риск для глобального общественного здоровья.[2]
По данным ВОЗ, в настоящее время нет циркулирующих вариантов, вызывающих интерес. Ранее циркулирующими вариантами, представляющими интерес, были Эпсилон, Зета, Эта, Тета, Йота, Капа, Лямбда и Мю.[2]
Вариант, вызывающий обеспокоенность
ВОЗ определяет вариант, вызывающий обеспокоенность, как вариант с установленной связью с одним или несколькими из следующих изменений, значимых для глобального общественного здоровья:[2]
Увеличение трансмиссивности или пагубное изменение эпидемиологии
Увеличение вирулентности или изменение клинических проявлений заболевания
Снижение эффективности мер общественного здравоохранения и социальных мер либо имеющихся средств диагностики, лечения или вакцин.
ВОЗ определяет линию варианта, вызывающего обеспокоенность и находящегося под наблюдением, как вариант, который, согласно филогенетическому анализу, принадлежит к циркулирующему в настоящее время варианту, вызывающему обеспокоенность, демонстрирует признаки преимущества в передаче по сравнению с другими циркулирующими линиями вариантов, вызывающих обеспокоенность, а также имеет дополнительные аминокислотные изменения, которые определенно или предположительно обеспечивают наблюдаемые изменения в эпидемиологии и преимущество в приспособленности по сравнению с другими циркулирующими вариантами.[2]
По данным ВОЗ, в настоящее время вариантом, вызывающим обеспокоенность, является Омикрон. Ранее циркулирующими вариантами, вызывающими обеспокоенность, были Альфа, Бета, Гамма и Дельта. В настоящее время линиями вариантов, вызывающих обеспокоенность и находящихся под наблюдением, являются линии Омикрон BA.4 и BA.5, а также сублинии BA.2 (BA.2.12.1, BA.2.9.1, BA.2.11, BA.2.13).[2]
Вариант Альфа
Вариант Альфа ранее классифицировали как вариант, вызывающий обеспокоенность.[2][3][4]
Линия по номенклатуре Pango: B.1.1.7.
Первые зарегистрированные образцы: Великобритания (сентябрь 2020 года).
Трансмиссивность: больше по сравнению с вирусом дикого типа.[3]
Тяжесть заболевания: ассоциируется с повышенным риском госпитализации, а также госпитализации в отделение интенсивной терапии (что предполагает более тяжелое заболевание), но не смерти, по сравнению с вирусом дикого типа; впрочем, данные противоречивы. Не ассоциируется с изменениями симптомов или их длительности.[5][6][7][8]
Вариант Бета
Вариант Бета ранее классифицировали как вариант, вызывающий обеспокоенность.[2][3][4]
Линия по номенклатуре Pango: B.1.351.
Первые зарегистрированные образцы: ЮАР (май 2020 года).
Трансмиссивность: не больше, чем Альфа.[3]
Тяжесть заболевания: информации недостаточно.[3]
Вариант Гамма
Вариант Гамма ранее классифицировали как вариант, вызывающий обеспокоенность.[2][3][4]
Линия по номенклатуре Pango: P.1.
Первые зарегистрированные образцы: Бразилия (ноябрь 2020 года).
Трансмиссивность: больше по сравнению с вирусом дикого типа, согласно ограниченным данным.[3]
Тяжесть заболевания: информации недостаточно.[3]
Вариант Дельта
Вариант Дельта ранее классифицировали как вариант, вызывающий обеспокоенность.[2][3][4]
Линия по номенклатуре Pango: B.1.617.2 (включая все подлинии AY).
Первые зарегистрированные образцы: Индия (октябрь 2020 года).
Трансмиссивность: больше по сравнению с вирусом дикого типа и вариантом Альфа.[3]
Тяжесть заболевания: ассоциируется с повышенным риском госпитализации (что свидетельствует о более тяжелом заболевании) по сравнению с одновременными случаями заболевания, вызванного вариантами Альфа и Бета; впрочем, эти выводы в значительной мере сомнительны. Общий уровень летальности меньше, чем при варианте Альфа.[3][9]
Вариант Омикрон
Вариант Омикрон (линия передачи B.1.1.529 по номенклатуре Pango) в настоящее время ВОЗ, UKHSA и CDC классифицируют как вариант, вызывающий обеспокоенность.[2][3][4] Омикрон – это высокодивергентный вариант с большим количеством мутаций. Не существует пути передачи, который бы связывал Омикрон с его предшественниками (Альфа, Дельта), и, согласно оценкам, его ближайший известный генетический предок, вероятно, циркулировал в середине 2020 года.[10] Случаи впервые были зарегистрированы в Южной Африке в ноябре 2021 года. Вариант Омикрон стал доминирующим вариантом во многих странах.
Вариант Омикрон охватывает несколько известных линий, в том числе родительскую линию B.1.1.529, и дочерние линии (или подварианты) BA.1, BA.1.1, BA.2 (и его различные сублинии), BA.3, BA.4 и BA.5. Линии BA.2, BA.4 и BA.5 в некоторых странах стали или становятся доминирующими субвариантами. Линии BA.4 и BA.5 классифицируют как варианты, вызывающие обеспокоенность, в Великобритании, и линии вариантов, вызывающих обеспокоенность, находящиеся под наблюдением ВОЗ.[2][3]
Трансмиссивность
Омикрон имеет существенное преимущество в плане роста по сравнению с Дельта и быстро заменил вариант Дельта по всему миру. Согласно важным доказательным данным, уклонение от распознавания иммунной системой способствует быстрому распространению вируса, однако неизвестно, насколько этому способствует характерная для него повышенная трансмиссивность; требуются дальнейшие исследования.[11]
Хотя данные свидетельствуют о том, что линия BA.2 обладает большей трансмиссивностью, чем BA.1, различие в их трансмиссивности, по-видимому, намного меньше, чем различие между BA.1 и Дельта.[12] Линия BA.2 продемонстрировала более высокие темпы роста по сравнению с BA.1.[3] Согласно предварительным данным из Южной Африки и Великобритании, линии BA.4 и BA.5 имеют преимущество в росте по сравнению с BA.2, при этом BA.5 растут быстрее, чем BA.4, в Великобритании.[3]
Степени тяжести заболевания
Данные свидетельствуют о более низкой тяжести течения заболевания и смертности для варианта Омикрон по сравнению с вариантом Дельта, после поправки на искажающие эффекты возраста, пола, этнической принадлежности, предшествующей инфекции, статуса вакцинации, сопутствующих заболеваний, а также влияния сферы деятельности и влияния государственного/частного сектора.[13]
Согласно доказательным данным, полученным в исследованиях на животных, Омикрон не инфицирует клетки глубоко в легких так же легко, как клетки верхних дыхательных путей.[14]
Различий в степени тяжести или частоте госпитализаций между BA.2 и BA.1 не отмечали.[3][12] В настоящее время нет доказательств того, что BA.4 и BA.5 вызывают более тяжелое заболевание, чем предыдущие варианты.[3]
Эффективность вакцины
Все больше доказательных данных указывает на эффективность вакцин против варианта Омикрон, и данные об этом получены из ЮАР, Великобритании, США, Канады и Дании. Предварительные данные свидетельствуют о том, что эффективность против инфекции, вызванной вариантом Омикрон, а также против симптоматического заболевания значительно ниже, чем против варианта Дельта, а ревакцинация гомологичными и гетерологичными вакцинами увеличивают эффективность вакцины. Оценки эффективности вакцины в отношении тяжелых исходов (например, госпитализации) ниже для варианта Омикрон по сравнению с вариантом Дельта, однако в основном остаются >50% после первичной серии и улучшаются после введения бустерной дозы до >80%.[11] Неизвестно, как долго длится эта повышенная защита, впрочем, по данным одного исследования, длительность такой защиты составляет 4–6 месяцев.[15]
Различий в эффективности между вакцинами BA.2 и BA.1 не отмечали. Данных, позволяющих определить, влияют ли линии BA.4 или BA.5 на эффективность вакцины, недостаточно. Однако предварительные анализы показывают, что вакцинальный статус в случаях инфицирования BA.4 и BA.5 существенно не отличается от вакцинального статуса в случаях инфицирования BA.2. Это свидетельствует о том, что защита остается сопоставимой с той, которую наблюдали ранее.[3]
Согласно некоторым новым данным, BA.4 и BA.5 в значительной степени ускользают от нейтрализующих антител, индуцированных как вакцинацией, так и инфекцией.[16]
Диагноз
Вариант Омикрон не влияет на диагностическую точность полимеразной цепной реакции и экспресс-тестов на антигены.[11]
Терапевтические мероприятия
Ожидают, что лечение тяжелого или критического заболевания будет по-прежнему эффективным. Впрочем, согласно имеющимся данным, нейтрализующее действие моноклональных антител на Омикрон и его субварианты может быть снижено.[11][17]
Повторная инфекция
О повышенном риске повторного заражения сообщали в ЮАР, Великобритании, США, Дании и Израиле.[11][18]
Рекомбинантные варианты
В ходе пандемии было идентифицировано несколько рекомбинантных вариантов SARS-CoV-2, и подавляющее большинство из них не дает вирусу каких-либо преимуществ и относительно быстро вымирает.[3]
Сообщалось о рекомбинантных линиях, связанных с вариантом Омикрон. Комбинация Омикрон-варианта BA.1 и Дельта-варианта (также известного как рекомбинант BA.1 x AY.4, XD и XF, или «дельтакрон») находится под наблюдением, но доступная информация в настоящее время ограничена. Также сообщалось о рекомбинанте Омикрон BA.1 и BA.2 (известном как XE).[3]
Источники
Доступны следующие ресурсы:
Использование этого контента попадает под действие нашего заявления об отказе от ответственности