Streptococcus pneumoniae (пневмококк) является самым распространенным возбудителем НГП различной тяжести у пациентов из разных возрастных групп.[14]Rice LB. Antimicrobial resistance in gram-positive bacteria. Am J Med. 2006 Jun;119(suppl 1):S11-9.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16735146?tool=bestpractice.com
[15]Cillóniz C, Ewig S, Polverino E, et al. Microbial aetiology of community-acquired pneumonia and its relation to severity. Thorax. 2011 Apr;66(4):340-6.
http://thorax.bmj.com/content/66/4/340.long
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21257985?tool=bestpractice.com
[16]Cillóniz C, Ewig S, Polverino E, et al. Community-acquired pneumonia in outpatients: aetiology and outcomes. Eur Respir J. 2012 Oct;40(4):931-8.
http://erj.ersjournals.com/content/40/4/931.long
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22267760?tool=bestpractice.com
[17]Cilloniz C, Torres A, Polverino E, et al. Community-acquired lung respiratory infections in HIV-infected patients: microbial aetiology and outcome. Eur Respir J. 2014 Jun;43(6):1698-708.
http://erj.ersjournals.com/content/43/6/1698.long
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24525448?tool=bestpractice.com
[18]Almirall J, Boixeda R, Bolíbar I, et al. Differences in the etiology of community-acquired pneumonia according to site of care: a population-based study. Respir Med. 2007 Oct;101(10):2168-75.
http://www.resmedjournal.com/article/S0954-6111%2807%2900194-1/fulltext
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17629472?tool=bestpractice.com
Однако некоторые исследования выявили, что вирус гриппа является наиболее распространенной причиной НГП у взрослых.[6]Alimi Y, Lim WS, Lansbury L, et al. Systematic review of respiratory viral pathogens identified in adults with community-acquired pneumonia in Europe. J Clin Virol. 2017 Oct;95:26-35.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28837859?tool=bestpractice.com
[12]Jain S, Self WH, Wunderink RG, et al. Community-acquired pneumonia requiring hospitalization among US adults. N Engl J Med. 2015 Jul 30;373(5):415-27.
http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa1500245
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26172429?tool=bestpractice.com
В Европе и США S. pneumoniae связана примерно с 30–35% случаев.[4]Mandell LA, Wunderink RG, Anzueto A, et al. Infectious Diseases Society of America/American Thoracic Society consensus guidelines on the management of community-acquired pneumonia in adults. Clin Infect Dis. 2007 Mar 1;44(suppl 2):S27-S72.
http://cid.oxfordjournals.org/content/44/Supplement_2/S27.long
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17278083?tool=bestpractice.com
[15]Cillóniz C, Ewig S, Polverino E, et al. Microbial aetiology of community-acquired pneumonia and its relation to severity. Thorax. 2011 Apr;66(4):340-6.
http://thorax.bmj.com/content/66/4/340.long
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21257985?tool=bestpractice.com
[19]Almirall J, Bolíbar I, Vidal J, et al. Epidemiology of community-acquired pneumonia in adults: a population-based study. Eur Respir J. 2000 Apr;15(4):757-63.
http://erj.ersjournals.com/content/15/4/757.long
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10780770?tool=bestpractice.com
Другие бактериальные причины включают Haemophilus influenzae, Staphylococcus aureus (в том числе МРЗС), стрептококки группы А и Moxarella catarrhalis.
Атипичные бактерии также являются распространенными причинами, хотя они различаются по частоте в зависимости от года и наличия эпидемий.[18]Almirall J, Boixeda R, Bolíbar I, et al. Differences in the etiology of community-acquired pneumonia according to site of care: a population-based study. Respir Med. 2007 Oct;101(10):2168-75.
http://www.resmedjournal.com/article/S0954-6111%2807%2900194-1/fulltext
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17629472?tool=bestpractice.com
[20]Marchello C, Dale AP, Thai TN, et al. Prevalence of atypical pathogens in patients with cough and community-acquired pneumonia: a meta-analysis. Ann Fam Med. 2016 Nov;14(6):552-66.
http://www.annfammed.org/content/14/6/552.long
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28376442?tool=bestpractice.com
Заболеваемость, вызванная атипичными патогенами при внебольничной пневмонии, составляет примерно 22% в глобальном масштабе, но это зависит от местоположения.[21]Arnold FW, Summersgill JT, Ramirez JA. Role of atypical pathogens in the etiology of community-acquired pneumonia. Semin Respir Crit Care Med. 2016 Dec;37(6):819-28.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27960206?tool=bestpractice.com
Наиболее распространенными атипичными бактериями являются Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae и Legionella pneumophila. M. pneumoniae является возбудителем у 37% пациентов с НГП, которые проходят амбулаторное лечение и 10% госпитализированных пациентов.[15]Cillóniz C, Ewig S, Polverino E, et al. Microbial aetiology of community-acquired pneumonia and its relation to severity. Thorax. 2011 Apr;66(4):340-6.
http://thorax.bmj.com/content/66/4/340.long
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21257985?tool=bestpractice.com
[4]Mandell LA, Wunderink RG, Anzueto A, et al. Infectious Diseases Society of America/American Thoracic Society consensus guidelines on the management of community-acquired pneumonia in adults. Clin Infect Dis. 2007 Mar 1;44(suppl 2):S27-S72.
http://cid.oxfordjournals.org/content/44/Supplement_2/S27.long
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17278083?tool=bestpractice.com
C. pneumoniae связана с 5–15% случаев НГП,[22]Torres A, Barberán J, Falguera M, et al. Multidisciplinary guidelines for the management of community-acquired pneumonia [in Spanish]. Med Clin (Barc). 2013 Mar 2;140(5):223.e1-223.e19.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23276610?tool=bestpractice.com
а L. pneumophila (особенно серогруппа 1) связана с 2–6% случаев НГП у иммунокомпетентных пациентов.[23]Mandell LA, Marrie TJ, Grossman RF, et al; The Canadian Community-Acquired Pneumonia Working Group. Canadian guidelines for the initial management of community-acquired pneumonia: an evidence-based update by the Canadian Infectious Diseases Society and the Canadian Thoracic Society. Clin Infect Dis. 2000 Aug;31(2):383-421.
http://cid.oxfordjournals.org/content/31/2/383.full
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10987698?tool=bestpractice.com
Систематический обзор выявил, что Chlamydia psittaci была возбудителем заболевания у 1% пациентов.[24]Hogerwerf L, DE Gier B, Baan B, et al. Chlamydia psittaci (psittacosis) as a cause of community-acquired pneumonia: a systematic review and meta-analysis. Epidemiol Infect. 2017 Nov;145(15):3096-3105.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28946931?tool=bestpractice.com
Однако исследование, проведенное в Голландии, идентифицировало C. psittaci с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) мокроты (при ее наличии) как причину внебольничной пневмонии в 4,8% случаев.[25]Spoorenberg SM, Bos WJ, van Hannen EJ, et al. Chlamydia psittaci: a relevant cause of community-acquired pneumonia in two Dutch hospitals. Neth J Med. 2016 Feb;74(2):75-81.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26951352?tool=bestpractice.com
Pseudomonas aeruginosa может также преобладать у пациентов с пневмонией зависимо от региона; однако по сравнению с НГП она чаще встречается при госпитальной и вентилятор-ассоциированной пневмонии. Систематический обзор в Китае показал, что она связана с 7,7% всех изолятов при НГП.[26]Ding C, Yang Z, Wang J, et al. Prevalence of Pseudomonas aeruginosa and antimicrobial-resistant Pseudomonas aeruginosa in patients with pneumonia in mainland China: a systematic review and meta-analysis. Int J Infect Dis. 2016 Aug;49:119-28.
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1201971216310992
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27329135?tool=bestpractice.com
Респираторные вирусы обнаруживают примерно у 10-30% взрослых со здоровым иммунитетом, госпитализированных с ВП.[15]Cillóniz C, Ewig S, Polverino E, et al. Microbial aetiology of community-acquired pneumonia and its relation to severity. Thorax. 2011 Apr;66(4):340-6.
http://thorax.bmj.com/content/66/4/340.long
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21257985?tool=bestpractice.com
[27]Jokinen C, Heiskanen L, Juvonen H, et al. Microbial etiology of community-acquired pneumonia in the adult population of 4 municipalities in eastern Finland. Clin Infect Dis. 2001 Apr 15;32(8):1141-54.
http://cid.oxfordjournals.org/content/32/8/1141.long
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11283803?tool=bestpractice.com
[28]Jennings LC, Anderson TP, Beynon KA, et al. Incidence and characteristics of viral community-acquired pneumonia in adults. Thorax. 2008 Jan;63(1):42-8.
http://thorax.bmj.com/content/63/1/42.long
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17573440?tool=bestpractice.com
[29]Burk M, El-Kersh K, Saad M, et al. Viral infection in community-acquired pneumonia: a systematic review and meta-analysis. Eur Respir Rev. 2016 Jun;25(140):178-88.
http://err.ersjournals.com/content/25/140/178.long
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27246595?tool=bestpractice.com
Вирус гриппа A/B, респираторно-синцитиальный вирус, аденовирус, риновирус и вирус парагриппа являются самыми распространенными вирусными причинами НГП у иммунокомпетентных взрослых. Сообщается о новых патогенах, вызывающих НГП, в том числе метапневмовирусах и коронавирусах.[30]Wunderink RG, Waterer G. Advances in the causes and management of community acquired pneumonia in adults. BMJ. 2017 Jul 10;358:j2471.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28694251?tool=bestpractice.com
Выявлению вирусов в качестве причин способствует использование ПЦР.
Полимикробная этиология ВП варьирует в пределах от 5,7% до 13% в зависимости от популяции и используемого диагностического микробиологического теста.[15]Cillóniz C, Ewig S, Polverino E, et al. Microbial aetiology of community-acquired pneumonia and its relation to severity. Thorax. 2011 Apr;66(4):340-6.
http://thorax.bmj.com/content/66/4/340.long
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21257985?tool=bestpractice.com
[28]Jennings LC, Anderson TP, Beynon KA, et al. Incidence and characteristics of viral community-acquired pneumonia in adults. Thorax. 2008 Jan;63(1):42-8.
http://thorax.bmj.com/content/63/1/42.long
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17573440?tool=bestpractice.com
[31]Johansson N, Kalin M, Tiveljung-Lindell A, et al. Etiology of community-acquired pneumonia: increased microbiological yield with new diagnostic methods. Clin Infect Dis. 2010 Jan 15;50(2):202-9.
http://cid.oxfordjournals.org/content/50/2/202.long
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20014950?tool=bestpractice.com